Asegurando, aunque sea de forma indiciaria, que mucho antes del año 1949 se practicaba fútbol de forma ocasional en Galapagar, sólo desde este año se tiene constancia de que se formó un primer equipo aficionado, con la idea de disputar algún partido esporádico contra equipos de los pueblos de los alrededores. Este equipo estaba formado por los siguientes jugadores: Mariano Escohotado, Victorio Martínez, Guillermo Guadaño, Mateo Andrés, Antonio Greciano, Marcelo Andrés, Alberto Cuesta, José Luis Mamolar, Florencio Zamorano, Eduardo Martín e Hilario Cuesta.

Con posterioridad, entre los años 1950 y 1960, se empezó a fomentar la celebración de partidos de fútbol con motivo de las fiestas patronales de los pueblos próximos al nuestro y también se organizaban partidos contra equipos formados en su mayoría por jugadores de Madrid, que pasaban en Galapagar sus vacaciones estivales, siendo el primer entrenador del equipo local en estas fechas D. Rafael Crespo Jiménez.

A principios del año 1969 se fundó como asociación juvenil y con sede en los salones parroquiales de la Iglesia de Nuestra Señora de la Asunción, lo que se denominó “ Club Juventud 69 “. Esta iniciativa, unida al hecho de que algunos jugadores locales tenían que desplazarse a localidades próximas, para poder jugar al fútbol a nivel de competición oficial, fue lo que determinó que ese mismo año se fundara el Club Deportivo Galapagar.

La primera Junta Directiva del Club estuvo formada por D. Mariano Alberquilla Greciano, como Presidente; D. José María Martín Esteban, como Vicepresidente; D. Emilio Cuesta Rubio, como Secretario, y el párroco local D. Angel Suárez Mingo, como Tesorero, nombrándose entrenador del equipo aficionado a D. Mariano Escohotado, y existiendo ya en esa época dos categorías inferiores, juveniles e infantiles.

El primer equipo aficionado del recién fundado Club Deportivo Galapagar estuvo formado por los siguientes jugadores: Arturo Guillén Gutiérrez, José Manuel Guillén Gutiérrez, Lorenzo García tejada, Miguel Andrés Alberquilla, Jesús Guillén Gutiérrez, Gabriel García Sacristán, Angel Robles Martínez, Agapito Endrinal Hernández, Francisco de Juan Guadaño, José Luis González Fernández, Fernando Fernández Calvo, José Tomás Román Capelo, Nicolás Fernández Calvo y Ramón García Trespallé.

Una vez fundado el Club se procedió a la captación de socios, siendo los diez primeros los siguientes:

Nº 1. Mariano Alberquilla Greciano.
Nº 2. José María Martín Esteban.
Nº 3. Angel Suárez Mingo.
Nº 4. Andrés Sanz de Castro.
Nº 5. Francisco Fragua Gómez.
Nº 6. Emilio Cuesta Rubio.
Nº 7. Ricardo Greciano de Juan.
Nº 8. Miguel Andrés Alberquilla.
Nº 9. Arturo Guillén Gutiérrez.
Nº 10. Juan Jiménez de las Heras.

En el año 1969, año de su fundación, como se ha expresado anteriormente el Club Deportivo Galapagar compitió en lo que se llamaba el "Segundo Campeonato Sierra de Madrid de Educación y Descanso", en el cual competían los siguientes doce equipos: Colmenarejo, Collado Mediano, El Escorial, Avance, Las Rozas, Becerril de la Sierra, Torrelodones, Las Matas, Los Molinos, Torpedo, Alpedrete y el C.D. Galapagar. Este campeonato comenzó el día 9 de noviembre de 1969, y finalizó el 29 de marzo de 1970, jugándose los partidos de casa en el campo de El Bailadero, en el que no había vallado, ni existían vestuarios y que estaba situado en lo que hoy es la calle Navalonguilla, nº 2 y 4, prácticamente enfrente del antiguo Cuartel de la Guardia Civil, en la carretera de Colmenarejo y que hoy es sede de la Policía Local y Protección Civil.

En la temporada 1970 – 1971 participamos en el Tercer Campeonato Sierra de Madrid de Educación y Descanso, donde participaron 10 equipos, siendo el nuestro el Campeón de esta competición.

En la temporada 1971 – 1972 nuestro Club participó en lo que se llamaba Campeonato de Liga “ Madrid – Toledo “ ( Grupo Norte ), en el que compitieron los siguientes equipos: Valdemorillo, Azuqueca, Juventud Pegaso, C.I.E. Camarma, V. de Luján, La Carretilla, Marchamalo, Humanes, Inter Palomares, Algete, Abellán, Aeropuerto, Avance, Navacerrada, Alpedrete y C.D. Galapagar.

En Septiembre del año 1972, los socios del Club y algunos otros vecinos de Galapagar construyeron de forma altruista el campo “ El Chopo “, utilizando para ello máquinas y camiones particulares y aportando los materiales y mano de obra necesarios, en un terreno propiedad del Ayuntamiento de Galapagar, coincidiendo casi totalmente con su ubicación actual.

El día 1 de Septiembre de 1972 el Club se inscribió en la Federación Castellana de Fútbol, participando en la temporada
1972 – 1973 en el Campeonato de Liga de Tercera Regional, Grupo 1º - Norte, en el que participaban los siguientes equipos: Atlético Pozuelo, Cebrereña, Leones de Castilla, Las Rozas, Torrelodones, Collado Villalba, El Escorial, San Lorenzo, Villalba, Navacerrada, San José de Valderas, Residencia Provincial, Hoyo de Pinares, Moraleja, Arévalo y C.D. Galapagar, y en el que nuestro equipo quedó Campeón de Grupo igualado a puntos con San Lorenzo, consiguiendo así el ascenso a la categoría de Segunda Regional.

En la temporada 1973 – 1974 participamos en el Campeonato de Liga de Segunda Regional ( Provincias ), Grupo 2º, con los siguientes 20 equipos: San Lorenzo, Hogar Alcarreño, Yepes, Criptanense, Uralita, Torrijos, San Prudencio, Los Yebenes, Atlético Pinto, La Solana, Daimiel, Acueducto, Santa Barbara, Colmenar Viejo, Sonseca, El Tiemblo, Tarancón, Construcciones Carrillo, Mejoreño y C.D. Galapagar, iniciándose la competición el 9 de septiembre y finalizando el 26 de junio. Los primeros puestos fueron ocupados por Torrijos, Atlético Pinto y Sonseca, acusando nuestro Club el cambio de categoría, y descendiendo a la 3ª categoría Regional Preferente.

En la temporada 1974 – 1975 nuestro equipo aficionado compitió en el Campeonato de Liga de Tercera Regional Preferente, Grupo 3º, en el que participaron los siguientes 20 equipos: San Lorenzo, Navalcarnero, Villalba, Arenas de San Pedro, Sigüenza, Cebrereña, San Sebastián de los Reyes, Burgohondo, Leones de Castilla, Marchamalo, Atlético Cercedilla, Avance, Moraleja, Hogar Alcarreño, El Escorial, Legamar, Villa del Prado, Aldea del Fresno, Mejoreño y C. D. Galapagar, iniciándose el campeonato el día 1 de septiembre y finalizando el 18 de mayo, realizando nuestro Club una gran temporada y consiguiendo el ascenso a la 2ª Categoría Regional.

En la temporada 1975 – 1976 nuestro equipo participó en el grupo 3º del Campeonato de Liga de la citada Segunda Regional,
con los siguientes 21 equipos: Arenas de San Pedro, San Lorenzo, Colmenar Viejo, Sigüenza, Tarancón, R.P. de Ávila, Burgohondo, Villa del Prado, Acueducto, Atlético Cercedilla, Navalcarnero, Torrijos, Cebrereña, U.D.C. Villalba, San Prudencio, Moraleja, Mejoreño, Marchamalo, Asland, El Escorial y C.D. Galapagar, iniciándose el campeonato el 14 de septiembre y finalizando el 13 de junio, ascendiendo nuestro Club a la 1ª categoría regional, tras obtener, en la penúltima jornada, un merecido y trabajado empate en el difícil campo de Colmenar Viejo, y una victoria en la última jornada en nuestro campo contra el Sigüenza C.F., por el resultado de 4 – 1. Es de reseñar que por primera vez en su historia , nuestro Club ante el importante partido contra Colmenar Viejo, concentró al equipo en el Hotel Arcipreste de Hita, de Navacerrada.

En la temporada 1976 – 1977 el equipo aficionado participó en el Campeonato de Liga de Primera Regional Castellana, con los siguientes 20 equipos: San Cristobal de Los Angeles, Daimiel, Yepes, Alcobendas, Colmenar Viejo, La Solana, Móstoles, Vallecas, Cañaveral, Pinto, Torrijos, Real Ávila, Barajas, Calpisa Las Rozas, Valdemoro, Manzanares, Carabanchel, Uralita, Villaverde y C.D. Galapagar, iniciándose la competición el día 3 de octubre y finalizando el 6 de julio. Nuestro equipo acusó mucho la nueva categoría, debido al gran nivel futbolístico del resto de los equipos, sufriendo mucho para mantenerse.

En esta temporada el C.D. Galapagar absorbió al que hasta entonces fue La Navata, C.F. , que hasta ese momento jugaba en un campo de fútbol que existía junto al río Guadarrama, pasando a ser desde ese momento un equipo “ B “ de categoría Aficionado, perteneciente al C.D. Galapagar, denominándose " C.D. Galapagar – La Navata".

El equipo C.D. Galapagar – La Navata estaba formado por varios jugadores del antiguo equipo de La Navata, C.F., al que se incorporaron un buen número de jugadores del equipo juvenil del año anterior del C.D. Galapagar.

En la temporada 1977 – 1978 el equipo aficionado compitió en el Campeonato de Liga de la Primera Regional Castellana, no pudiendo mantener la categoría y descendiendo a la Segunda Regional.

En la temporada19 78 – 1979 nuestro equipo participó en el Campeonato de Liga de la Segunda Regional, Grupo 3º, de la Federación Castellana de Fútbol, con los siguientes 18 equipos: Fuenlabrada, Arenas, La Granja, Cercedilla, Marchamalo, Cebrereña, Hogar Alcarreño, El Álamo, Fuensalida, Collado Villalba, Torpedo 66, Leones de Castilla, Illescas, R. P. Avila, Loeches, Sigüenza, Asland, y C.D. Galapagar, iniciándose el campeonato el 16 de septiembre y finalizando el 8 de junio.

En la temporada 1979 –1980 nuestro equipo aficionado participó en el Campeonato de Liga de la Segunda Regional, Grupo 3ª, compitiendo contra otros 17 equipos.

En la temporada 1980 – 1981 el equipo aficionado siguió compitiendo en la Segunda Regional, cuyo Campeonato de Liga comenzó el día 21 de septiembre, finalizando el 7 de junio, con los siguientes 18 equipos: Cebrereña, Atlético Velilla, La Granja, Arenas, Hogar Alcarreño, Colmenar, Horche, Virgen Soledad, Marchamalo, El Escorial, R.P. Avila, Atlético Cercedilla, Sigüenza, San Prudencio, Torpedo 66, Torrejón Promesas, El Álamo, y C.D. Galapagar.

En la temporada 1981 – 1982 nuestro equipo aficionado siguío compitiendo en la Segunda Regional, manteniendo la categoría.

En la temporada 1982 – 1983 se continuó en la misma categoría compitiendo contra los siguientes equipos: El Tiemblo, Humanes, Robledo, San Lorenzo, Villa del Prado, Arévalo, Atlético Leones de Castilla, Cebrereña, El Álamo, San Rafael, Navas del Rey, Sotillo, El Espinar, Cercedilla, San Martín, Diamante.

En la temporada 1983 - 1984, nuestro equipo aficionado participó en el Campeonato de Liga de la Segunda Regional Grupo 5º de la Federación Castellana de Fútbol, iniciándose el campeonato el 18 de septiembre y finalizando el 3 de junio, con los siguientes equipos: Olombrada, Arevalo, Sporting Riaza, Cerceda, Atlético Leones de Castilla, Arévalo e Hijos, Sepúlveda, Cantalejo, Atlético Villalba, Los Molinos, Carbonero, Torrelodones, Las Navas, Diamante, San Lorenzo, El Espinar, San Rafael y C.D. Galapagar. La plantilla de nuestro equipo estaba formada por los siguientes jugadores: Santi, Carlos, Mario, Juan Carlos, Felipe, Antonio, José Tomás, Pedro, Pasti, Pepe, Casanova, Joaquín, Fernando, Yayo, Mariano, Ángel, Luís, Javi, Montero y Felix.

En la temporada 1984 - 1985, nuestro equipo aficionado militó, en la Segunda Regional Grupo 5º de la Federación Castellana de Fútbol manteniendo la categoría.

En la temporada 1985 - 1986, nuestro equipo aficionado compitió en la Segunda Regional, Grupo 5º de la Federación Castellana de Fútbol, comenzando el Campeonato el 15 de septiembre y finalizando el 1 de junio, con los siguientes equipos: El Escorial, Valsaín, Olombrada, Los Molinos, Las Navas, Atlético Leones de Castilla, Cebrereña, Torrelodones, Atlético Villalba, Carbonero, El Tiemblo, Moralzarzal, Navas del Rey, Chapinería, Piedrahita, Riaza, Arévalo y C.D. Galapagar, manteniendo la categoría.

En la temporada 1986 - 1987 nuestro equipo aficionado participó en el Campeonato de Liga de la Segunda Regional Grupo 2º de la Federación Castellana de Fútbol, iniciándose el 21 de septiembre y finalizando el 14 de junio, con los siguientes equipos: Lucero, Atlético Surbatán, Robledo, C. La Cañada, Toboso, El Escorial, Racing 74, El Bierzo, Alcotán, Oromar, River Plate, Arganzuela, Águilas Lucero, R. Garvin, E. Boadilla, Don Boy, Boadilla y C.D. Galapagar, manteniendo la categoría.

En la temporada 1987 - 1988, nuestro equipo aficionado militó en la Segunda Regional Grupo 2º de la Federación Castellana de Fútbol, comenzando el Campeonato el 20 de septiembre y finalizando el 5 de junio con los siguientes equipos: Boadilla, El Bierzo, Sporting Olvido, Atlético Surbatán, B. Progreso, Alcotán, La Salle C., P. Europa, Valdemorillo, A. Lucero, Sporting Arganzuela, Fontanes, Oromar, Galileo, El Escorial, G. Loyola, E. Boadilla y C.D. Galapagar.

En la temporada 1988 - 1989 , nuestro equipo aficionado militó en la Segunda Regional Grupo 2º de la recíen fundada Federación de Fútbol de Madrid, comenzando el Campeonato el 18 de septiembre, y finalizando el 11 de junio, participando los siguientes equipos: La Salle – Carabanchel, Atlético Surbatán, Atlético Villalba, Aluche, Hoyo de Manzanares, Boadilla, Juventud Europa, Sporting Arganzuela, Batán, El Bierzo, Higueras, Alcotán, Alpedrete, Águilas Lucero, Arboleda, Encinas de Boadilla, Parque Europa y C. D. Galapagar. Nuestro equipo realizó una gran temporada ascendiendo a la Primera Regional, como segundo clasificado del grupo, siendo campeón del mismo el Atlético Surbatán. El último partido nuestro equipo jugó contra Alpedrete, en su casa, empatando a cero goles.

En la temporada 1989 – 1990, nuestro equipo aficionado compitió en el Grupo I de la Primera Regional de la Federación de Fútbol de Madrid, comenzando el Campeonato el 17 de septiembre, y finalizando el 10 de junio, con los siguientes equipos: Esc. Pozuelo, C. Pinar del Rey, Cañaveral, Sporting Hortaleza, San Lorenzo, Dínamo Estrecho, Parque Atlético Pozuelo, C. Villalba, Sallema, Fundación, Cultural Peñarol, Osiris Argüellles, El Escorial, Carranza, Villa Rosa, Canillas, E.M.T. y C. D. Galapagar.

En la temporada 1990 - 1991, nuestro equipo aficionado siguió compitiendo en el Grupo I de la Primera Regional de la Federación de Fútbol de Madrid, comenzando el Campeonato el 16 de septiembre y finalizando el 9 de junio, con los siguientes equipos: Virgen de la Paloma, Unión de Aravaca, Atlético Alcobendas, Tres Cantos, E.M.T., Atlético Leones de Castilla, Pozuelo, Argüelles, Fundación, Parque Atlético Pozuelo, Dínamo Estrecho, Esc. Calasanz Pozuelo, Carranza, El Escorial, Alpedrete, Cañaveral, Don Bosco y C. D. Galapagar. En esta temporada se federó un segundo equipo aficionado denominado “ C.D. Galapagar B“, que compitió en el Grupo X de la Tercera Regional Ordinaria de la Federación de Fútbol de Madrid.

En la temporada 1991 - 1992, nuestro equipo aficionado compitió en la Primera Regional Grupo I de la Federación de Fútbol de Madrid, comenzando el Campeonato el 15 de septiembre y finalizando el 7 de junio, con los siguientes equipos: San Lorenzo, Unión de Aravaca, C.U. Collado Villalba, Atlético Alcobendas, Dínamo Estrecho, Huracán B-2, E.M.T., Fundación Peñarol, Atlético Pozuelo, Tres Cantos “ A “, E.C. Pozuelo, Leones de Castilla, A.D.U. Barrio del Pilar, San Agustín, Cerceda, Celtic Castilla, El Escorial y C. D. Galapagar.

En la temporada 1992 - 1993, nuestro equipo aficionado militó en la Primera Regional Grupo I de la Federación de Fútbol de Madrid, comenzando el campeonato el 20 de septiembre, y finalizando el 6 de junio, participando los siguientes equipos: Aravaca, San Agustín, Barrio de El Pilar, Carranza, C.F. Ebro, Cerceda, Parque Pozuelo, Escolapios, Argüelles, Peñarol, Dínamo Estrecho, Alcobendas, C.D. Avenida, Cañaveral, Don Bosco, A. Pozuelo, Tres Cantos y C.D. Galapagar.

En la temporada 1993 - 1994, participamos en la Primera Regional Grupo I de la Federación de Fútbol de Madrid, manteniendo la categoría.

En la temporada 1994 - 1995, nuestro equipo aficionado participó en la Primera Regional Grupo I de la Federación de Fútbol de Madrid, comenzando el campeonato el día 18 de septiembre y finalizando el 11 de Junio, con los siguientes equipos: C.D. El Escorial, C.D Las Rozas “ B “, A.D.C. Fundación – Peñarol, C.D. Ebro, C.D. Saconia, U.D. Cañaveral, C.D. San Pedro Prosperidad, Valleluz 90, C.D. Pozuelo de Alarcón “ B “, C.D.J. Periso, C.D. La Paz, C.F. San Federico, C.D. Tres Cantos “ A “, Atº Leones de Castilla “ A “, Aravaca, C.F., Villanueva del Pardillo, San Agustín y C.D. Galapagar “ A “. Se realizó una más que meritoria temporada, ascendiendo a la Categoría Preferente, tras ganar en el último partido de liga al C.F. San Agustín por un contundente 0 – 4.

En la temporada 1995 - 1996 nuestro equipo aficionado “ A “ jugó por primera vez en su historia en la categoría Preferente de la Federación de Fútbol de Madrid, comenzando el campeonato el 17 de septiembre, y finalizando el 16 de junio, participando los siguientes equipos: Roma C.F., A.D.U. Barrio del Pilar, C.D. Vicalvaro, C.D. Barajas, “ A “, C.D. Carranza, C.D. Loeches, Atº. E. Coslada, A.D. El Pardo, Torrejón C.F., U.C. Villalba, C.F. Pozuelo, A.D. Alcobendas “ A “, C.D. Moratalaz “ A “, Dínamo de Estrecho C.F., C.D. Aravaca, A.D. Esperanza “ A “, C.D.J. Periso y C.D. Galapagar “ A “. Nuestro equipo tras haber realizado un enorme esfuerzo en el ascenso y ante equipos de un gran nivel no pudo mantener la categoría descendiendo a la Primera Regional Ordinaria. En esta temporada el equipo Aficionado “ B “ tras una gran campaña consiguió ascender a la Segunda Regional Ordinaria.

En la temporada 1996 - 1997 el aficionado “ A “ militó en la Primera Regional Ordinaria de la Federación de Fútbol de Madrid, comenzando el campeonato el 15 de Septiembre y finalizando el 8 de Junio, participando los siguientes equipos: Tornado F.C. “ A “, C.D.C. Virgen de la Paloma, Atº Cercedilla, A.D. Fundación, C.D. Unión de Aravaca, Moralzarzal C.F. “ A “, E.F. Barrio del Pilar, Valleluz-90, C.F. Huarte – La Paz “ A “, A.D. Colmenar Viejo “ B “, C.F. Rayo Majadahonda “ B “, Dínamo Estrecho C.F., C.D. Don Bosco “ A “, C.F. San Federico, U.D. Cañaveral, C.D. Las Rozas “ B “, Escolapios Calasanz Pozuelo y C.D. Galapagar “ A “. El equipo aficionado “ A “ ascendió de nuevo a la categoría Preferente, tras obtener un valioso empate en el último partido en el campo del C.F. San Federico. Por su parte, el equipo aficionado “ B “ no pudo mantener la categoría descendiendo a la Tercera Regional Ordinaria.

En la temporada 1997 - 1998 nuestro equipo participó en la categoría Preferente de la Federación Madrileña de Fútbol, iniciándose el campeonato el 21 de Septiembre y concluyendo el 7 de Junio. Participaron los siguientes equipos: C.D. Mejoreño, Roma C.F., C.D. Coslada “ B “, A.D.U. Barrio del Pilar “ A “, Deportivo Alcalá C.F., A.D. Alcobendas “ A “, C.D.Barajas, Aravaca C.F., Atº. Cercedilla, U.C. Villalba “ A “, C.D.Moratalaz “ A “, C.D. Avance, A.D. El Pardo, Vallecas C.F., C.D. Santa Eugenia, C.D. Vicalvaro “ A “, Torrejón C.F. y C.D. Galapagar “ A “. Nuestro equipo mantuvo la categoría.

En la temporada1998 - 1999 nuestro equipo aficionado “ A “ militó en la categoría Preferente de Aficionados de la Federación de Fútbol de Madrid, comenzando el campeonato el 22 de Septiembre y finalizando el 6 de Junio, participando los siguientes equipos: A.D. Torrejón de Ardoz, U.C. Villalba “ A “, Deportivo Alcalá, A.D. Alcobendas “ A “, Atº. Leones de Castilla, Rosillo 75, A.D. El Pardo, C.D.J. Periso, C.D. Fuencarral, C.D. Vicalvaro “ A “, Moralzarzal C.F. “ A “, A.D.U. Barrio del Pilar, C.D. Moratalaz “ A “, C. D. Mejoreño, C.D. Santa Eugenia, Atº. Cercedilla, Torrejón C.F. y C.D. Galapagar “ A “, no pudiendo nuestro equipo mantener la categoria, descendiendo a Primera Regional ordinaria.

En la temporada 1999 - 2000 nuestro equipo participó en la categoría Primera de Aficionados de la Federaciónde Fútbol de Madrid , comenzando el campeonato el 19 de Septiembre y terminando el 4 de Junio, participando los siguientes equipos: C.D. Fuencarral, U.D. Boadilla, C.D.C. Virgen Paloma, A.D. Calasanz Pozuelo, C.B. Nuestra Señora de Luján, C.F. Rayo Majadahonda “ B “, U.D. San Lorenzo, C.D.F. Tres Cantos “ A “, A.D. Fundación, C.D. Liceo Sorolla – Pozuelo “ A “, E.F. Madrid Oeste, Dinamo de Estrecho, C.F., San Agustín de Guadalix, C.F., C.F. Pozuelo de Alarcón “ A “, Los Amigos de Santa Ana, C.F. Hoyo de Manzanares, Moralzarzal C.F. “ A “, y C.D. Galapagar “ A “, manteniendo la categoría.

En la temporada 2000 - 2001 jugamos en la categoría Primera de Aficionados de la Federación de Fútbol de Madrid, dando comienzo la temporada el 17 de Septiembre y finalizando el 3 de Junio, participando los siguientes equipos: Atº. Leones de Castilla “ A “, Deportivo Santa Ana “ B “, A.D. El Real de Manzanares, C.F. Pozuelo de Alarcón “ A “, C.D.F. Tres Cantos “ A “, E.F. Madrid Oeste, C.F. Hoyo de Manzanares “ A “, Dínamo de Estrecho, C.F., A.D. Fundación, Moralzarzal C.F. “ A “, Tornado – Tres Cantos “ A “, F.C. Villanueva del Pardillo, C.B. Nuestra Señora de Luján, C.D.C. Virgen Paloma, Centro D. Brunete, A.D. El Pardo, A.D. Recuerdo – Airtel y C.D. Galapagar “ A “, manteniendo la categoría.